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生物資訊

The Scientist:過去30天遺傳學和基因組學七大新聞

作者:towersimper 來源:生命科學論壇 發布時間: 2011-05-27 14:57  瀏覽次數:
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【Towersimper注:本文為譯文,僅用作研究之用,不得用作商業開發,轉載請標明翻譯者towersimper】

 

[The Scientist: May 24, 2011 by Cristina Luiggi]

1.長鏈非編碼RNA的新作用

利用染色體形成的環,基因間的長鏈非編碼RNA(long intergenic noncoding RNA, lincRNA)能激活相隔超遠距離的HOXA基因(其基因家族參與細胞成型化),這也是已知的為數不多的lincRNA激活基因的例子之一。

K.C. Wang, et al., "A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression," Nature, 472:120-4, 2011. Evaluated by W. Lee Kraus, Univ of Texas; Panagiotis Ntziachristos and Iannis Aifantis, HHMI/New York Univ School of Medicine; Leonie Ringrose, Inst of Molecular Biotechnology GmbH, Austria; Pamela Geyer, Univ of Iowa.

2.染色體分離

(圖片來源于維基百科)

細胞分裂期間,要使得染色體正確分離,紡錘體微管必須合適地附著到稱作著絲粒(kinetochore)的蛋白復合體上。研究人員發現,細胞通過激酶Aurora B磷酸化和蛋白磷酸酶1(PP1)去磷酸化著絲粒蛋白來調控這個過程。

D. Liu, et al., "Regulated targeting of protein phosphatase 1 to the outer kinetochore by KNL1 opposes Aurora B kinase1," J Cell Biol,188:809-20, 2011. Evaluated by Tomoyuki Tanaka, Univ of Dundee, UK; Stefan Westermann, Research Institute of Molecular Pathology, Austria; Laura Trinkle-Mulcahy. Univ of Ottawa, Canada; Vincent Vanoosthuyse and Kevin Hardwick, Univ of Edinburgh, UK.

3. 消除脅迫在植物中留下的遺傳記憶

當遭遇環境脅迫因素(stressor),如熱時,植物激活稱作逆轉錄轉座子(retrotransposon)的可移動遺傳因子(mobile genetic element),而逆轉錄轉座子復制自己,并插入到基因組內,誘導遺傳變化,從而有助于植物應對環境脅迫。在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中,小干涉性RNA(siRNA)抑制由熱脅迫激活的逆轉錄轉座子轉錄,從而在有性繁殖之前消除環境脅迫在基因組上留下的痕跡,這樣就能確保植株后代沒有儲存脅迫留下來的遺傳記憶。

H. Ito, et al., "An siRNA pathway prevents transgenerational retrotransposition in plants subjected to stress," Nature, 6472:115-9, 2011. Evaluated by Robert Sablowski, John Innes Centre, UK; Renate Schmidt, IPK Gatersleben, Germany; Ian Henderson, Univ of Cambridge, UK.

4.同行評審的黃金規則

在細胞的分子生物學(Molecular Biology of the Cell)雜志的一篇社論中,雜志主編為怎樣成為一名公正的和建設性的評審員提供一些指導規則,其中第一條規則就是“除非你做到公正無私,否則從不接受邀請去評審他人的稿件”。

DG Drubin, "Any jackass can trash a manuscript, but it takes good scholarship to create one (how MBoC promotes civil and constructive peer review)," Mol Biol Cell, 22:525-7, 2011. Evaluated by Etienne Joly, CNRS, France; Ferdinando Boero, Universita' del Salento, Italy; Gerald Zamponi, Univ of Calgary, Canada; Larry Kane, Univ of Pittsburgh.

5.谷氨酸受體類似蛋白(GLR)的新作用

針對秀麗隱桿線蟲的陰門成型化(vulval patterning),人們提出了兩種機制,最新研究表明這兩種機制并不是相互排斥的。根據一個計算模型,這兩種途徑之間相互作用的變化導致能選擇兩種不同的細胞成型化模式中的一種:順序模式(級聯模式)信號轉導或產生成形素(morphogen)梯度,這樣就解決了關于陰門細胞命運的長期爭執。

E. Michard, et al., "Glutamate receptor-like genes form Ca2+ channels in pollen tubes and are regulated by pistil D-serine," Science, 332:434-7, 2011. Evaluated by Heng-Cheng Hu and Caren Chang, Univ of Maryland; Wagner Araujo and Alisdair Fernie, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Germany; Wataru Sakamoto, Okayama Univ, Japan.

6.揭示植物去甲基化機制

活躍的DNA去甲基化,這是一個人們了解很少的表觀遺傳學過程,涉及到除去胞嘧啶堿基上的甲基基團。過量表達的酶TET-1能誘導這一過程發生,它把一個羥基基團添加到甲基化的胞嘧啶上,將之作為去甲基化的標簽。

J.U. Guo, et al., "Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain," Cell, 145:423-34, 2011. Evaluated by Elisabetta Tabolacci and Giovanni Neri, Universit? Cattolica del S Cuore, Italy; Faraz Sultan and David Sweatt, Univ of Alabama at Birmingham

7.植物死亡調節物

眾所周知,植物蛋白酶metacaspase的動物同源物調節凋亡和發炎。研究發現植物擬南芥metacaspase也參與調節程序性細胞死亡和天然免疫(innate immunity),表明這些功能在不同物種之間高度保守。

N.S. Coll, et al., "Arabidopsis type I metacaspases control cell death," Science, 330:1393-7, 2011. Evaluations by Daniel Gallie, Univ of California; Beno?t Lacroix and Vitaly Citovsky, SUNY at Stony Brook; Alexei Kurakin and Roya Khosravi-Far, Beth Israel Deaconess Medical Center。

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