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生物資訊

我國科學家解析人胞質亮氨酰-tRNA合成酶的CP發卡結構域

作者:admin 來源:生化細胞所 發布時間: 2014-08-02 08:32  瀏覽次數:
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 我國科學家解析人胞質亮氨酰-tRNA合成酶的CP發卡結構域

示意圖:CP發卡結構域在亮氨酰-tRNA合成酶的一級序列和三級結構中的位置(紫色)

亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)催化亮氨酸和對應tRNALeu之間的酯化反應。亮氨酸和異亮氨酸、甲硫氨酸、正纈氨酸的結構非常相似,亮氨酰-tRNA合成酶對上述氨基酸的辨別能力很低,有可能生成錯誤的氨基酰-tRNALeu。在進化中,亮氨酰-tRNA合成酶在原始的催化結構域之上招募了新的編校結構域,對誤氨基酰化產物進行水解,確保蛋白質翻譯過程正確進行。連接催化結構域和編校結構域之間的氨基酸序列被稱為CP發卡結構域。人們普遍認為,這一結構域可能維持酶的空間結構,并參與了酶催化過程中的構象變化,然而對其細節知之甚少。

來自王恩多研究組的科研人員黃騫等刪除了人胞質亮氨酰-tRNA合成酶的CP發卡結構域,發現酶的氨基酸活化能力和氨基酰化能力完全喪失,tRNA結合能力極大削弱,而編校功能幾乎不受影響。他們構建了一系列原核、真核和古細菌的嵌合體亮氨酰-tRNA合成酶,發現只有來自于真核生物酵母的亮氨酰-tRNA合成酶CP發卡結構域可以替代人胞質亮氨酰-tRNA合成酶CP發卡結構域的功能。通過結構和序列分析他們發現,這一結構域的柔性氨基酸殘基參與了酶催化過程中的構象變化,對于酶的氨基酸活化能力和氨基酰化能力的發揮至關重要,而極性氨基酸殘基則負責酶與tRNALeu的結合過程。

這一結果有助于人們更好的了解亮氨酰-tRNA合成酶的催化原理,發現人胞質亮氨酰-tRNA合成酶和致病菌亮氨酰-tRNA合成酶的結構差異,有針對性的設計新的抗生素藥物。

該項工作得到了國家科技部,國家基金委和中國博士后科學基金會的支持。

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